云南有九大高原湖泊，其中滇池、程海和泸沽湖属长江水系，抚仙湖、杞麓湖、异龙湖、星云湖和阳宗海属珠江水系，洱海属澜沧江水系。
滇池：湖泊面积平方公里，流域面积平方公里，平均水深4.4米。年水质为Ⅴ类标准。
洱海，湖泊面积平方公里，流域面积平方公里，平均水深20.5米。年水质为Ⅲ类标准。
洱海，湖泊面积平方公里，流域面积平方公里，平均水深20.5米。年水质为Ⅲ类标准。
抚仙湖：湖泊面积平方公里，流域面积.69平方公里，平均水深87.0米。年水质为Ⅰ类标准。
程海：湖泊面积74.6平方公里，流域面积.3平方公里，平均水深25.7米。年水质为Ⅳ类标准。
泸沽湖：湖面面积50.1km2，流域面积.6平方公里，平均水深40.3米，与四川共有。年水质为Ⅰ类标准。
杞麓湖：湖泊面积35.9平方公里，流域面积.2平方公里，平均水深4米。年水质为Ⅴ类标准。
星云湖：湖泊面积34.7平方公里，流域面积平方公里，平均水深5.91米。年水质为劣Ⅴ类标准。
阳宗海：湖泊面积31.9平方公里，流域面积平方公里，平均水深20米。年水质为Ⅲ类标准。
异龙湖：湖泊面积30.63平方公里，流域面积.4平方公里,平均水深2.75米。年水质为Ⅴ类标准。